转录辅助因子对不同类型的核心核糖体具有特异性

2021-12-06 02:46:42 来源:

核苷酸辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与核糖体间传输基因表达线索，是核苷酸诱导和基因表达的框架效应质。虽然已证明某些COF比其他COF更一般而言某些核糖体类型，但是相异COF对相异核糖体推断显露的内在特异性的程度尚不清楚。在一项新的分析之前，来自奥地利维也纳生质区域内分子病理学分析所的分析医护人员在黑腹酵母菌S2细胞核之前运用于数据采集核糖体活性测定来挑选23个COF诱导7.2万个候选框架核糖体（core promoter， CP）的能力。相关分析结果于2019年5月15日该网站发表在Nature期刊上，论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些分析医护人员观察到框架核糖体的差异诱导，这表明COF与特定类型的框架核糖体间依赖于着相异的适度一般而言或者说“兼容性（compatibilities）”。这些功能相异的框架核糖体在TATA捆、下游核糖体积体电路（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等已知的序列积体电路上差异性地石英砂，并在内源性碱基上推断显露相异的线粒体特性。值得注意的是，这些框架核糖体类型在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上依赖于相异的相对丰度，这表明这些组蛋白修饰可能需要区隔反式适度因子而不是核糖体和增强子类型的顺式适度积体电路。这些分析医护人员证明在人细胞核和另外两种酵母菌细胞核之前证明了相异COF-框架核糖体兼容性的依赖于。为此，他们发现了分别一般而言TATA捆和CpG岛核糖体的COF。COF和框架核糖体间的相异兼容性需要解释相异的增强子如何特异性地诱导相异组的基因、完全一致基因内的可变核糖体（alternative promoter）和完全一致核糖体内的相异核苷酸起始碱基。综上所述，COF-框架核糖体兼容性可能是酵母菌和生命等相异质种之前相异核苷酸程序的基础。原始原文：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]