Cell Res:杭州基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

2022-02-14 12:16:31 来源:
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R-loop 是一种由 RNA:DNA 杂合链和核酸 DNA 组合而成的类似于核酸结构,在激酶和真核生物的基因组中都分布为广泛且由来已久。R-loop 在很多关键的免疫学更进一步中都发挥重要原则上功能,包括肝细胞器标记、RNA转录、DNA 损伤修复以及基因组准确性等,但其如何被可靠转录的机制尚为不相符。m6A 标记作为几天后 RNA 上丰度最高的标记各种类型,为广泛参与哺乳动物的成年期、免疫、干肝细胞更新、三酸甘油酯同化、以及生成和转到等精神上更进一步。然而,现有尚为不相符 m6A 是否能作为 R -loop 中都 RNA 溶剂的本源特征来转录 R -loop 高度,进而发挥各种免疫学原则上功能。中都科院上海基因组学术研究所杨运桂、任捷与中国人民大学生科院孙前文他的团队合作伙伴学术研究,注意到 m6A 能保持稳定 R-loop 的成型,进而转录基因RNA的必要中都止。这一实质性以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》专题于 10 月 12 日离线发表于《肝细胞学术研究》(Cell Research)杂志。学术研究他的团队首先通过斑点分子杂交和免疫荧光高效率,注意到敲低 m6A 甲基转到酶 METTL3 显着提高 R -loop 高度,且该转录作用依赖于 METTL3 甲基转到酶活性。随后,他的团队领导者借助于高效气相色谱牵头晶体学高效率,注意到相较于染色体结合的 RNA(caRNA),R-loop 的 RNA 溶剂有更加富集的 m6A 标记。全面借助于基于核酸 DNA 建库的 DNA:RNA 杂合链免疫总计沉淀高通量分子生物学高效率(ssDRIP-seq),注意到下调的 R -loop 主要富集在RNA中都止区域,R-loop 发生变化往往与 m6A 的距离和标记高度特别。为了探求 m6A 对 R -loop 转录的免疫学原则上功能,学术研究他的团队绘制了 RNA 磷酸化RNA底物的高分辨率图谱,并在 MYC、ACTIN 基因上来进行多种RNA活性检测,注意到 m6A 促进 R -loop 成型是RNA中都止阶段的关键步骤,可以避免 RNA 磷酸化的RNA通读。再次,他的团队领导者构建了针对RNA通读的报告基因系统,通过 m6A 标记底物的变异全面证实 m6A 对于 R -loop 成型及RNA中都止的关键。该学术研究注意到了 m6A 磷酸化标记的总计RNA转录原则上功能,揭示了 RNA 磷酸化标记对肝细胞器结构的影响,以及 R-loop 结构中都的 RNA 溶剂被标记后对其自身波形的转录机制,阐释了 m6A 通过保持稳定 R-loop 而促进RNA也就是说中都止的周期性,为全面学术研究 m6A 与 R-loop 的转录机制和附加免疫学原则上功能发放了原则上的高效率和观点坚实。该学术研究受益了中都国科学院战略先导科技专项、国际组织自然科学以及国际组织重点生产方案等基金资助。更早引自:Xin Yang, Qian-Lan Liu, Wei Xu, et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).
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