Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 产生及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和多肽 DNA 合组的特殊多肽构造，在线粒体和真核生物体的基因组之中分布广泛应用且普遍存在。R-loop 在很多关键的分子生物体学处理过程之中把握不可忽视特性，有数染色质标记、磷酸化催化反应、DNA 细菌感染修复以及基因组稳定性等，但其如何被精确催化反应的必要尚不确切。m6A 标记作为信使 RNA 上轻元素最高的标记类型，广泛应用直接参与哺乳动物的成年期、免疫细胞、干细胞升级、脂肪酸分化、以及效用于和转移等生命处理过程。然而，迄今为止尚不确切 m6A 到底能作为 R -loop 之中 RNA 小分子的本源相似性来催化反应 R -loop 水平，进而把握各种分子生物体学特性。之中科院北京基因组学术研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文制作组协力学术研究，挖掘出 m6A 能稳定 R-loop 的转变成，进而催化反应基因磷酸化的直接之中止。这一成就以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》主旨于 10 月 12 日在线发表于《细胞学术研究》（Cell Research）新闻周刊。学术研究制作组首先通过斑点分子杂交和免疫细胞荧光关键技术，挖掘出敲低 m6A 甲基转移酶 METTL3 孝着降低 R -loop 水平，且该催化反应效用依赖于 METTL3 甲基转移酶活性。随后，制作合组员利用高效液相气相建立联系质谱法关键技术，挖掘出远比于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 小分子有更加氟化物的 m6A 标记。实质性利用基于多肽 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链免疫细胞共约沉淀高通量测序关键技术（ssDRIP-seq），挖掘出下调的 R -loop 主要氟化物在磷酸化之中止地区，R-loop 变动程度与 m6A 的一段距离和标记水平相关。为了探索 m6A 对 R -loop 催化反应的分子生物体学特性，学术研究制作组所画了 RNA 转录磷酸化启动子的三维图谱，并在 MYC、ACTIN 基因上顺利进行多种磷酸化活性检测，挖掘出 m6A 促使 R -loop 转变成是磷酸化之中止阶段的关键步骤，可以防范 RNA 转录的磷酸化通读。最后，制作合组员构建了针对磷酸化通读的报告基因系统，通过 m6A 标记启动子的突变实质性证实 m6A 对于 R -loop 转变成及磷酸化之中止的主导效用。该学术研究挖掘出了 m6A 选择性标记的共约磷酸化催化反应特性，揭示了 RNA 选择性标记对染色质构造的负面影响，以及 R-loop 构造之中的 RNA 小分子被标记后对其自身一个系统的催化反应必要，概述了 m6A 通过稳定 R-loop 而促使磷酸化出现异常之中止的物理现象，为实质性学术研究 m6A 与 R-loop 的催化反应必要和相应分子生物体学特性发放了基本的关键技术和方法论支撑。该学术研究给予了之中国科学院关键性先导科技专项、国家所学术研究以及国家所重点研发计划等基金资助。原始典故：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).